- Connaitre l’existence des bases de données et savoir aller rechercher de l’information.
- Pouvoir aller chercher des séquences nucléotidiques ou protéiques et en connaitre les formats
- Savoir établir des correspondances entre les bases de données (par exemple rechercher des correspondances entre numéros d’accession des bases NCBI et Ensembl)
- Pouvoir comparer des séquences deux à deux, faire des comparaisons multiples, designer des amorces et des sondes pour la PCR et la PCR quantitative en incluant différentes stratégies (exemples: détection de variants ARNm, clonage).
- Avoir des notions d’analyse fonctionnelle, savoir calculer des moyennes, des écarts-types et des p-values, pouvoir établir des listes de gènes différentiellement exprimés, être capable d’utiliser ces listes de gènes dans certains logiciels pour avoir des notions de voies dérégulées ou de fonctions perturbées.
´Séance 1 : Vendredi 22
septembre 2023 13h30 : Les bases de
données informatives UE1
´Séance 2 : Lundi 25 septembre
2023 11h : Les bases de
données de séquences et de correspondances
UE1
´Séance 1&2 sup Mardi 03 octobre
2023 10h UE1 Exercices
´Séance 3 & 4 : Jeudi 09
novembre 2023 10h & Mercredi
22 novembre 2023 8h: Comparaison de
séquences et choix d’amorces UE2
´Séance 5: lundi 27
novembre 2023 9h & Lundi 08 janvier 2024 9h: Analyse fonctionnelle UE2
´Séance 6 : lundi 15
janvier 2024 13h30 : Exercice de synthèse UE2
´Séance 7: Lundi 22 janvier 2024 9h: contrôle final UE1 & UE2
- Enseignant: ANNE WIERINCKX