Les enseignements du M2 Bio-Tiss sont organisés en deux semestres : un semestre d'automne (S3) et un semestre de printemps (S4).
Pendant le S3, les enseignements comportent des UEs disciplinaires obligatoires apportant les connaissances approfondies et récentes sur les mécanismes fondamentaux assurant la formation, la réparation et l'homéostasie des tissus, ainsi que sur les stratégies employées pour l’ingénierie tissulaire, mais aussi des compétences en imagerie/microscopie, ainsi qu'en analyse d'images. Des UEs transversales permettent d'acquérir les savoirs indispensables pour mener une carrière scientifique (dont la gestion de projet) et une UE optionnelle est à choisir parmi un large panel, permettant d'élargir ses connaissances dans un domaine spécifique.
Pendant le S4 (de janvier à juin), les étudiants effectuent un stage en laboratoire de recherche, public ou privé ou au sein d'une plateforme d'imagerie, en France ou à l'étranger.